隨著分子生物技術在生物學、醫學等方面的廣泛應用,RNA提取已成為研究基因表達、克隆目的基因等的一項基本試驗技術。高質量RNA的提取,是后續RT-PCR、qPCR、Northern blot、cDNA文庫構建等正常進行的必要前提。Trizol法是一種常見的提取總RNA的方法,在RNA得率及試劑成本方面具有一定的優勢。
圖1 Trizol法提取RNA流程
Trizol是一種較為流行的總RNA抽提試劑,可以直接從細胞或組織中提取總RNA。其含有苯酚、異硫氰酸胍等物質,能迅速破碎細胞并抑制細胞釋放出的核酸酶,因此對于純化RNA及標準化RNA的生產來說使用價值相對比較高。
圖2
? Trizol是動植物細胞、組織或者細菌的總RNA抽提試劑;
? 主要含有苯酚、異硫氰酸胍等物質,能迅速破碎細胞并抑制細胞釋放出的核酸酶。苯酚主要用于裂解細胞、變性蛋白,同時使部分RNase失活,保護RNA;異硫氰酸胍可降解細胞、溶解蛋白質,使蛋白質的二級結構消失、使核蛋白與核酸分離,進而使核內的RNA被釋放出來,并且抑制RNase活性;
? 抽提所得RNA無DNA和蛋白污染。一般所得RNA溶于DEPC水后的A260/280值為8-2.0;
? 裂解細胞或和組織共勻漿時,Trizol可以保持樣品中RNA的完整性,即可以有效抑制RNA的降解;
? 每一百萬細胞用Trizol抽提可得5-15μg RNA;每毫克組織用Trizol抽提可得1-10μg RNA,產量因細胞和組織不同而異;
?Trizol抽提所得RNA可直接用于Northern,點雜交,純化mRNA,體外翻譯,RNase protectionassay,cDNA克隆,以及RT-PCR;也可以用于基因表達芯片分析、高通量測序等對RNA質量要求較高的情況。
氯仿是分子量比較大的有機溶劑,在提取RNA時,氯仿可以有效的使有機相和無機相迅速分離。加入氯仿,離心后,樣品即分成水樣層(RNA存在于水樣層)、中間層(DNA和蛋白質存在于中間層)和有機層。
細化它的主要作用點:
(1)作為有機溶劑變性蛋白,使其沉淀并通過離心除去,同時也通過變性作用抑制RNase活性;
(2)RNA提取試劑中通常含有苯酚(Trizol主要成分就是苯酚),苯酚微溶于水,抽提烷之后水相里有痕量的酚,如果不除去會損傷核酸,需要通過氯仿把水相里參與的苯酚抽提掉;
(3)作為溶劑抽提樣品中的一些脂溶性雜質(比如油脂、脂溶性色素等),起到一定除雜作用。
異丙醇的作用主要是沉淀RNA。RNA存在于水樣層中,收集水樣層后可以通過異丙醇沉淀RNA來還原。離心前沉淀不可見,離心棄上清后,可見膠狀的RNA沉淀。
75%乙醇主要由乙醇和DEPC水配置,主要用來洗滌粘附在RNA沉淀上的氯仿跟異丙醇。
DEPC處理水是經DEPC(即diethyl pyrocarbonate,焦碳酸二乙)處理過并經高溫高壓滅菌的超純水(一級水),是一種無色液體。經檢測不含雜質RNA、DNA、核酸酶和蛋白質。本產品可以用于RNA沉淀的溶解,含有RNA的各種反應體系,以及其它要求無RNase、DNase和proteinase的反應體系。
分類 | 貨號 | 產品名稱 | 規格 |
離心管 | abs7119 | 1.5ml離心管(無菌無酶) | 500支/盒,10盒/箱 (1袋/盒) |
abs7118 | 0.5ml離心管(無菌無酶) | 1500支/袋,10袋/箱 | |
吸頭 | abs7071 | 10μL濾芯吸頭(盒裝 無菌無酶) | 96支/盒,100盒/箱 |
abs7074 | 200μL濾芯吸頭(盒裝 無菌無酶) | 96支/盒,100盒/箱 | |
abs7077 | 1000μL濾芯吸頭(盒裝 無菌無酶) | 96支/盒,50盒/箱 | |
abs7176 | 20μL濾芯吸頭(盒裝 無菌無酶) | 96支/盒,100盒/箱 | |
abs7072 | 10μL吸頭(盒裝 無菌無酶) | 96支/盒,100盒/箱 | |
abs7073 | 10μL吸頭(袋裝 無酶) | 1000支/袋,10袋/箱 | |
abs7075 | 200μL吸頭(盒裝 無菌無酶) | 96支/盒,100盒/箱 | |
abs7076 | 200μL吸頭(袋裝 無酶) | 1000支/袋,20袋/箱 | |
abs7078 | 1000μL加長吸頭(盒裝 無菌無酶) | 96支/盒,50盒/箱 | |
abs7079 | 1000μL吸頭(盒裝 無菌無酶) | 96支/盒,50盒/箱 | |
abs7080 | 1000μL吸頭(袋裝 無酶) | 500支/袋,10袋/箱 | |
abs7081 | 1000μL加長吸頭(袋裝 無酶) | 500支/袋,10袋/箱 |
一、細胞裂解
1、組織樣本:
Trizol用量:每50-100mg 組織加1 ml Trizol,樣品體積不應超過Trizol體積的10%。
(1)將動物或植物組織切成小塊,在液氮中磨碎或用勻漿器勻漿處理;
(2)將研磨好的組織粉末快速轉入裝有1ml Trizol的2 ml離心管中,在渦旋振蕩器上迅速振蕩混勻,置于冰上,待所有的樣品研磨完;
(3)裂解產物應呈澄清的透明粘稠液體。對于富含蛋白、脂肪或多糖物質的組織樣品如肌肉、脂肪組織和植物結節部位等,勻漿后仍會存留有不溶物質,可于4℃ 12,000 x g 離心10min,然后吸取上清至一新的離心管中。
2、細胞樣本:
(1)貼壁細胞:吸盡培養液,每10cm2培養面積(6孔板單孔或35 mm平皿)加入1ml Trizol,用加樣器吹打數次,以確保細胞裂解,然后轉移至離心管中。注:Trizol的使用量應由培養皿表面積決定,而非由細胞數目決定。Trizol量不足可能導致提取的RNA中有DNA污染;
(2)懸浮細胞:離心收集細胞,吸盡液體,每 5-10×106動植物或酵母細胞,或每 1×107細菌細胞加入1ml Trizol,用加樣器吹打,使其裂解,然后轉移至離心管中。
注:添加Trizol前切勿洗滌細胞 ,以免RNA降解。必要時可以用勻漿器來裂解某些細菌或者酵母細胞。
二、液相分離
(1)裂解產物于室溫放置5min,使核酸-蛋白復合物分離;(注:此時樣品可在-80℃長期保存。)
(2)每1ml Trizol加入0.2ml氯仿,蓋緊管蓋,劇烈振蕩15s,室溫放置2-3min;
(3)4℃ 12,000 x g離心15min,樣品會分成三層:桔黃色的下層有機相,中間層和無色的上層水相;
(4)吸取含總RNA的上層水相至一新的離心管中,吸取水相的體積為所用Trizol試劑的60%。
三、RNA回收
(1)按照每1ml Trizol的最初使用量加入0.5ml異丙醇,顛倒數次混勻,室溫放置10min;
(2)4℃ 12,000 x g 離心10min,棄除上清,可見膠狀的RNA沉淀;
(3)按照每1ml Trizol的最初使用量加入1ml 75%乙醇,顛倒數次混勻,洗滌沉淀;
(4)4℃ 12,000 x g離心5min,棄除上清;
(5)室溫倒置5-10min晾干或真空抽干(不要使用真空干燥離心機,以免RNA過干,難以溶解);
(6)加入適量(如25ul)DEPC-ddH2O或TE緩沖液,用加樣器吹打數次溶解RNA;
(7)通過RNA電泳以及紫外分光光度計檢測,確定RNA的濃度、純度和完整性;
(8)所得的RNA應立即使用或適量分裝后-80℃保存,避免反復凍融。
除以上介紹的單品Trizol(abs60154)外,還有Trizol(總RNA抽提試劑盒)(abs9331)包含有RNA提取全流程的試劑。
貨號 | 產品名稱 | 規格 | 包含試劑名稱 | 體積 |
abs9331 | Trizol(總RNA抽提試劑盒) | 1Kit | Trizol | 100ml |
分相試劑BCP | 10ml | |||
異丙醇 | 50ml | |||
75%乙醇 | 100ml | |||
DEPC水 | 10m |
參考文獻
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[2]Eldh M, L?tvall J, Malmh?ll C, et al. Importance of RNA isolation methods for analysis of exosomal RNA: evaluation of different methods[J]. Molecular immunology, 2012, 50(4): 278-286.
[3]王華, 李華. 保存動物組織內 RNA 的方法改進[J]. 生物技術通報, 2010 (6): 152-155.
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