組化筆使用方法，先將組織切片脫蠟水化，然后用薄紙抹去在玻片上的組織邊緣的液體，再用免疫組化筆在玻片上被檢體周圍畫圈或在組織邊緣上下各畫一條線，干燥10-15秒，之后將玻片浸在PBS耐熱性能，試驗過程中的耐熱性為120攝氏度以下。石蠟組織切片的畫圈，切片脫蠟水化，PBS沖洗，甩干PBS液，在組織片周圍畫圈，油圈距離組織片邊緣2-3mm；在使用實驗用免疫組化筆畫線之前，先用吸水紙將切片周圍擦干。所畫的圈應在室溫下干燥1-2分鐘后再進行下一步操作流程。如果需要使用胰蛋白酶或其它蛋白酶消化或者進行抗原熱修復處理切片，應待這些步驟完成后再使用實驗用免疫組化筆。

 

  冰凍切片的畫圈，將載玻片清洗干凈，用防脫片劑(如Poly-L-Lysine或APES)防脫處理，切片、貼片，PBS浸洗組織片，甩干PBS液，在組織片周圍畫圈，畫圈距離組織邊緣2-3mm；在使用實驗用免疫組化筆畫線之前，先用吸水紙將切片周圍擦干。所畫的圈應在室溫下干燥1-2分鐘后再進行下一步操作流程。如果需要使用胰蛋白酶或其它蛋白酶消化或者進行抗原熱修復處理切片，應待這些步驟完成后再使用實驗用免疫組化筆。

 

  細胞培養皿\培養玻片的畫圈，以PBS清洗培養皿內\培養玻片上的細胞后，傾去PBS緩沖液，用實驗用免疫組化筆直接畫于培養皿\培養玻片的細胞培養面。在使用實驗用免疫組化筆畫線之前，先用吸水紙將切片周圍擦干。所畫的圈應在室溫下干燥1-2分鐘后再進行下一步操作流程。一次性細胞培養皿染色結束后不宜用二甲苯透明（可重復使用的玻璃材質的培養皿或玻璃材質的培養玻片可以），可用甘油類或水溶性封片劑直接滴加于染色的細胞上，再行封片。

 

  組化筆適用范圍，實驗用免疫組化筆（畫圈筆）有疏水隔離作用，適用于免疫組學實驗過程中在組織周圍畫圈，通過在組織片周圍畫圈可以避免浪費試劑。防止滴加在玻片或平皿上抗體、探針等液體擴散，減少損失，將玻片或平皿分隔成多個區域，便于免疫染色，原位雜交，以及其它組織學、細胞學、 細胞培養、病毒學及微生物學研究，使多張切片或多種抗體/探針能在同一玻片或培養皿里染色、比較，圈內切片或細胞可用醛類、乙醇或丙酮固定。