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類器官crispr-cas9基因編輯及慢病毒轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)方法

更新時(shí)間:2023-08-25      點(diǎn)擊次數(shù):635

近幾年,類器官研究十分火熱,在信號(hào)通路機(jī)制,藥篩藥敏等研究中對(duì)類器官模型需求激增,其中利用crispr-cas9基因編輯技術(shù)對(duì)類器官進(jìn)行敲低或敲減來造模是個(gè)不錯(cuò)的實(shí)驗(yàn)方法,今天小愛帶大家來了解crispr-cas9基因編輯技術(shù)及慢病毒轉(zhuǎn)染方法。

crispr基因編輯技術(shù)中有三個(gè)最為重要的組成部分:crRNA、sgRNA和Cas9蛋白。crRNA與Cas9蛋白形成復(fù)合物,sgRNA指引(crRNA/cas9)復(fù)合物靶向目的DNA區(qū)域定向切割DNA,從而達(dá)到基因編輯的目的。


圖1 crispr-cas9基因編輯技術(shù)示意圖

 

crispr-cas9基因編輯技術(shù)大體上有三種技術(shù)路線:All in one質(zhì)粒轉(zhuǎn)染法,病毒轉(zhuǎn)化法,RNP復(fù)合物導(dǎo)入法。病毒轉(zhuǎn)化法是將sgRNA、crRNA和表達(dá)cas9蛋白的序列整合進(jìn)病毒中,再使用病毒感染細(xì)胞。相較于質(zhì)粒轉(zhuǎn)染法,優(yōu)點(diǎn)在于sgRNA、crRNA和表達(dá)cas9蛋白可以持續(xù)存在于細(xì)胞中,從而達(dá)到一個(gè)很高的基因編輯效果。


圖2 慢病毒轉(zhuǎn)染細(xì)胞示意圖

 

很多小伙伴對(duì)類器官轉(zhuǎn)染方法十分好奇,類器官慢病毒轉(zhuǎn)染和細(xì)胞轉(zhuǎn)染大同小異,主要有以下幾個(gè)問題需要注意:

 

1、類器官在進(jìn)行慢病毒轉(zhuǎn)染時(shí)需不需要從基質(zhì)膠里解離出來?

考慮到病毒對(duì)于基質(zhì)膠的穿透性及轉(zhuǎn)染效率,轉(zhuǎn)染時(shí)建議將類器官?gòu)幕|(zhì)膠中解離出來,用適當(dāng)培養(yǎng)基重懸在孔板內(nèi)進(jìn)行。

 

2、類器官在進(jìn)行慢病毒轉(zhuǎn)染時(shí)需不需要消化成單個(gè)細(xì)胞?

類器官在進(jìn)行慢病毒轉(zhuǎn)染時(shí),消化成單個(gè)細(xì)胞來轉(zhuǎn)染效率比較高,建議消化成單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行感染。

 

3、類器官轉(zhuǎn)染慢病毒多長(zhǎng)時(shí)間合適?

轉(zhuǎn)染時(shí)間可根據(jù)實(shí)際實(shí)驗(yàn)情況調(diào)整,通常是轉(zhuǎn)染12-36小時(shí),可以借鑒細(xì)胞轉(zhuǎn)染時(shí)間。

 

4、類器官篩選時(shí)要不要消化成單個(gè)細(xì)胞?如果不需要消化,從膠里解離出來就行?還是在基質(zhì)膠里就行?

類器官篩選不需要消化成單個(gè)細(xì)胞,在基質(zhì)膠里就可以篩選,大部分的藥物都可以穿透基質(zhì)膠,作用到類器官上。

 

以下給大家整理了類器官轉(zhuǎn)染步驟:

 

1)收集類器官并消化成單個(gè)細(xì)胞后,按2×105/孔鋪到24孔板中(細(xì)胞密度可以自行摸索);
2)用含有6μg/ml polybrene(polybrene的濃度可以自行摸索)的1ml新鮮類器官培養(yǎng)基替換原培養(yǎng)基,加入適量病毒懸液,37℃孵育;
3)(對(duì)polybrene毒性敏感的細(xì)胞選作此步驟)4小時(shí)后加入1ml新鮮培養(yǎng)基以稀釋polybrene;
4)繼續(xù)培養(yǎng)12-36小時(shí)后,如有少量細(xì)胞貼壁,可用槍頭輕柔吹打下來,混勻,將細(xì)胞培養(yǎng)基混懸液收集至離心管中(一般是6-8孔為一組)。300g 4℃ 富集離心5min后移去上清,添加1ml左右類器官傳代培養(yǎng)緩沖液(abs9730)轉(zhuǎn)移到1.5mlEP管,重新重懸離心;
5)觀察收集到的組織體積,添加25倍組織體積的基質(zhì)膠(abs9495)重懸混勻(金屬冰盒或冰上操作);
6)以24孔細(xì)胞培養(yǎng)板為例,每孔點(diǎn)膠25ul組織基質(zhì)膠混合物進(jìn)行鋪板(金屬冰盒或冰上操作),將鋪好的培養(yǎng)板放入37℃培養(yǎng)箱中10-15min成膠,添加500-750μl 類器官培養(yǎng)基(恢復(fù)室溫)進(jìn)行培養(yǎng);
7)待類器官出現(xiàn)明顯增殖現(xiàn)象(一般需要2-3天),更換含有藥物的類器官培養(yǎng)基進(jìn)行篩選(如嘌呤霉素等),沒有轉(zhuǎn)染成功的類器官將會(huì)裂解凋亡,從而篩出成功轉(zhuǎn)染的類器官;

(* 圖源網(wǎng)絡(luò),僅供學(xué)習(xí)參考用)

 

今天講解就到這了,大家如有實(shí)驗(yàn)問題,歡迎公眾號(hào)后臺(tái)交流哦!


貨號(hào)

品名

規(guī)格

abs9495

基質(zhì)膠(低因子、無(wú)酚紅)

1.5ml*4/ 1.5ml*8

abs9730

類器官傳代培養(yǎng)緩沖液

250ml/ 250ml

abs9444

Organotial人肝癌類器官培養(yǎng)基試劑盒

1kit

abs9445

Organotial人結(jié)直腸癌類器官培養(yǎng)基試劑盒

1kit

abs9443

Organotial人肺癌類器官培養(yǎng)基試劑盒

1kit

abs9449

Organotial人胃癌類器官培養(yǎng)基試劑盒

1kit

abs9447

Organotial人胰腺癌類器官培養(yǎng)基試劑盒

1kit

abs9589

Organotial人鼻咽癌類器官培養(yǎng)基試劑盒

1kit

abs9739

Organotial人腦膠質(zhì)瘤類器官培養(yǎng)基試劑盒

1kit

abs9446

Organotial人乳腺癌類器官培養(yǎng)基試劑盒

1kit

abs9514

Organotial小鼠正常腸類器官培養(yǎng)基試劑盒

1kit

abs9516

Organotial小鼠正常肝類器官培養(yǎng)基試劑盒

1kit

abs9515

Organotial小鼠正常肺類器官培養(yǎng)基試劑盒

1kit

abs9643

Organotial小鼠正常胃類器官培養(yǎng)基試劑盒

1kit

abs9583

Organotial豬子宮內(nèi)膜類器官培養(yǎng)基試劑盒

1kit

abs9591

Organotial奶牛乳腺類器官培養(yǎng)基試劑盒

1kit

 

好消息!Absin文獻(xiàn)獎(jiǎng)勵(lì)重磅升級(jí)!


 


Absin特色產(chǎn)品線:

WB相關(guān):ECL發(fā)光液、預(yù)染marker、預(yù)制膠;IHC相關(guān):二抗試劑盒、組化筆;IP/CoIP試劑盒;激動(dòng)劑/抑制劑;血清、BSA、蛋白酶K、CTB、TTX、CEE;凋亡試劑盒;呼吸爆發(fā)試劑盒;ELISA試劑盒;重組蛋白;抗體: 二抗、標(biāo)簽抗體、對(duì)照抗體;定制服務(wù)(抗體/多肽/蛋白/標(biāo)記/檢測(cè))...

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