WB實驗是我們平時經常接觸到的實驗類型,也是經典的免疫學實驗,每年寫WB實驗技巧的文章,真是讓人看花了眼,如果你厭倦了老生常談的實驗技巧,不如來看看我們今天的拓展,WB在半定量分析之外的妙用吧。
一、目標蛋白構象結合功能分析
WB 用于構象分析,主要基于其不同構象形式時分子量所發生的變化,比如不同的寡聚、翻譯后修飾、配體結合等情況。還原和非還原型電泳分析鏈間二硫鍵,并判斷蛋白聚合情況;
抗體表位分析法初步判斷蛋白空間結構;利用(N - 端或 C - 端)抗體研究蛋白異構體及翻譯后酶切修飾;更重要的是,WB 等方法獲得的是蛋白在寡聚、結合配體、底物、信號標簽等生理條件下,其分子量的動態變化,從而將蛋白結構研究與功能研究有機結合。
泛素化-蛋白酶體系統對于錯誤蛋白降解具有重要意義。上圖顯示 Nrf2 蛋白在泛素連接酶作用時間延長后,泛素化程度逐漸增加。若將各時間點的 Nrf2 蛋白結構解析,即可將該蛋白的結構研究與功能研究相結合。在 Virology 的這篇文獻中,作者發現蛋白酶體抑制劑 MG132 和 lactacystin 可顯著降低豬 II 型圓環病毒(PCV2)早期感染的滴度,并通過對泛素基因的沉默實驗,發現其也顯著降低 PCV2 滴度,由此推斷泛素 - 蛋白酶體系統是 PCV2 的早期復制所必須的。
二、磷酸化信號分析
磷酸化是細胞信號系統的重要調節方式,特異的磷酸化抗體可以用于:分析信號分子磷酸化水平,從而與其功能研究建立聯系;分析不同磷酸化位點對于信號分子功能的影響,比如 p53 總磷酸化水平與不同位點磷酸化水平對轉錄的調控,以及與癌癥發生發展之間的聯系。
Cai 等在JBC上發表的文章,揭示了微小RNA在腫瘤發生中的調節作用。研究發現微小RNA miR-17/20a 靶向抑制 p53 的核心激酶DAPK3(死亡相關蛋白激酶 3)的表達,去除這些微小 RNA 將導致依賴于 p53 的微小RNA轉錄抑制被去除,從而形成一個正反饋環,促進腫瘤形成,它們被稱為原癌微小 RNA(oncomiRs)。C圖清楚顯示了當對 Hela 細胞轉入 miR-17、miR-20a 或 miR-17/20a 拮抗劑后,DAPK3 蛋白表達增加,雙鏈 DNA 不穩定性的標志物 ATM(Ser-1981)、p53BP1(Ser-25/29)蛋白絲氨酸磷酸化程度增高,而各自總蛋白水平并沒有變化。D 圖進一步確認了這些磷酸化水平升高是由 DAPK3 表達量升高引起的。p53 磷酸化水平升高將導致其抑制原癌微小 RNA 轉錄的水平下降,進一步提高 DAPK3 激酶的表達。該研究補充了原有的通過 E2F 家族蛋白激活 miR-17/20a 的負反饋調節通路。
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abs922 | 預染蛋白marker, 10-180kDa | 500ul | 492 |
abs924 | 預染蛋白marker, 10-180kDa | 2×250ul | 372 |
abs923 | 預染蛋白marker | 500ul/5*500ul | 600/2400 |
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