針對樣品的常見問題:
Q:細胞水平要做Western Blot,多少細胞提的蛋白夠Western Blot?
A:一般地5* 106就足夠了。
Q: 同一樣品能同時提RNA又提蛋白嗎,這樣對Western Blot有無影響?
A:能,沒有問題的。
Q: 同一蛋白樣品能同時進行兩種因子的Western Blot檢測嗎?
A:當然可以,有的甚至可以同時測幾十種樣品。
Q: 如果目標蛋白是膜蛋白或是胞漿蛋白,操作需要注意什么?
A: 如果是膜蛋白和胞漿蛋白,所用的去垢劑就要溫和得多,這時建議加上NaF去抑制磷酸化酶的活性。
Q: 蛋白變性后可以存放多久?
A:-80℃,一兩年沒有問題。zui關鍵兩條:不要被蛋白酶水解掉;不要被細菌消化掉(也是被酶水解了)。
Q: 如果上樣量超載,要用什么方法來增加上樣量?如果需要加大上樣量使原來弱的條帶能看清楚。
A:可以濃縮樣品,也可以根據你的目標分子量透析掉一部分小分子蛋白。一般地,超載30%是不會有問題的。如果已經超了不少了,而且小分子量的也要,可以考慮加大膠的厚度,可以試試1.5mm厚度的凝膠。
Q: 接下來我準備采用DAB顯色技術,二抗是生物素化的多克隆抗體,三抗是親和素生物素體系,不知采用這樣的方案后,封閉液是否要作調整,能否再用5%的脫脂奶粉呢?好像有資料說脫脂奶粉會影響親和素生物素的生成,是嗎?
A:不能使用脫脂奶粉,因為脫脂奶粉中含生物素,用BSA代替應該好一點,此外如果用于磷酸化指標蛋白的檢測時也不能用脫脂奶粉,因為脫脂奶粉中含有酪蛋白。
Q:一般一次上樣的蛋白總量是多少,跟目的蛋白的表達量有關系嗎?
A:Western Blot一般上樣30-100微克不等,結果跟目的蛋白的豐度、上樣量、一二抗的量和孵育時間都有關系,也與顯色時間長短有關。開始摸條件時,為了拿到陽性結果,各個步驟都可以量多一點時間長一點,當然背景也就出來了。要拿到好的結果,如果抗體好的話比較容易,抗體不好的話就需要反復地試了,當然有的不適合Western Blot的怎樣做也不行。所以拿到好的結果不容易。
Q: 做組織樣品的western的時候,處理樣品有什么訣竅嗎?還有,您用過大牛血清做封閉劑嗎?濃度如何?效果是不是比BSA好一點?
A:組織樣品必須進行研磨、勻漿超聲處理,蛋白質溶解度會更好,離心要充分,膜蛋白需用更劇烈的方法抽提,低豐度膜蛋白可能還要分步抽提(超速離心)。還有一點就是組織中的蛋白酶活性更強,需要注意抑制蛋白酶的活性(加入PMSF和蛋白酶抑制劑 cocktail),封閉劑一般5%脫脂奶粉較常用。如果一抗為多克隆抗體,使用BSA也是不錯的選擇。
Q: 大分子量蛋白200 kD,在做western要注意什么呢?
A:做200kd蛋白的Western Blot時要注意,分離膠建議選擇>7%的;剝膠時要小心;轉移時間需要相應延長;要做分子量參照(否則出現雜帶不知道如何分析)。
Q:蛋白的上樣量有沒有什么具體的要求?
A:上樣量要根據實驗的要求來定, 如果要求是定量和半定量的Western Blot 則上樣量要均等, 如果只是要定性,則沒有太大的關系, 盡量多上就行了, 但是不要超過0.3μg/mm2。
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