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WB試驗之如何選擇內參抗體

更新時間:2017-11-17      點擊次數:6929

檢測某一個基因的表達產物或者要比較表達產物量的相對變化,方法是western blot。而Western Blot試驗中比較這些的前提條件是等量的細胞上樣,這樣才有比較的基礎。而人為的操作會產生一定的誤差,這些誤差可以通過測定每個樣品中實際轉到膜上的內參來校正。因此選擇一個合適的內參抗體來校正上樣誤差是非常重要的。所以嚴謹的Western Blot實驗設計中需要有良好的參照體系,后續的實驗結果分析才具有說服性。

在Western Bloting實驗中,可能內參即是內部參照(Internal Control),對于哺乳動物細胞表達來說一般是指由管家基因編碼表達的蛋白(Housekeeping Proteins),它們在各組織和細胞中的表達相對恒定,在檢測蛋白的表達水平變化時常用它來做參照物。

在Western Blotting 中使用內參其實就是在WB過程中的另外用內參對應的抗體檢測內參,這樣在檢測目的產物的同時可以檢測內參的表達,由于內參在各組織和細胞中的表達相對恒定,借助檢測每個樣品內參的量就可以用于校正上樣誤差,這樣半定量的結果才更為可信。此外使用內參可以作為空白對照,檢測蛋白轉膜情況是否*、整個Western Blot顯色或者發光體系是否正常。

常用的細胞總蛋白質內參有GAPDH、beta-actin和beta-tubulin等。對于一些植物的樣本,則需要特別的植物Actin蛋白作為內參,同樣的,如果提取的樣本是細胞核蛋白,那么PCNA或者組蛋白H3都是被經常使用的,而針對一些研究線粒體的客戶,那么Cox IV則被較多的文獻引用作為線粒體總蛋白的內部參考。下面就常用的一些內參抗體做一些介紹。

1.GAPDH抗體

GAPDH(甘油醛-3-磷酸脫氫酶)是參與糖酵解的一種關鍵酶,由4個30-40kDa的亞基組成,分子量146kDa,檢測條帶大約在36kDa。GAPDH基因幾乎在所有組織中都高水平表達,被廣泛地用作Western blot蛋白質標準化的內參。

 

2. β-Tubulin抗體

Tubulin即微管蛋白,是細胞的一種骨架蛋白。Tubulin分為α、β、γ、δ、ε等多種tubulin,其中α-Tubulin和β-Tubulin可以形成異源二聚體,是形成微管的zui主要的兩種Tubulin。α-tubulin和β-tubulin分子量分別為55kDa和50kDa,其實際檢測條帶均在55kDa左右。作為內參,β-tubulin的蛋白水平通常不會發生改變,因此被廣泛用于Western Blotting時上樣量是否一致的參照,α-Tubulin和β-Tubulin構成微管蛋白的結構也常被用于免疫染色觀察細胞的微管結構。

 

3. Beta-Actin內參抗體

Actin即肌動蛋白,是細胞的一種重要骨架蛋白。Actin大致可分為六種,其中四種是不同肌肉組織特異性的,其余兩種廣泛分布于各種組織中,包括 β-actin和γ-non-muscle actin。β-actin作為內參是得到了*的,這是針對大多數組織和細胞來說的,它廣泛分布于細胞漿內,表達量非常豐富,其含量占所有細胞總蛋白的50%。但是在一些少量特殊的情況下,如脂肪組織或細胞β-Actin抗體推薦—價的內參抗體內,β-Actin的表達量就很少。β-actin由375個氨基酸組成,分子量大小為42-43kDa左右。

 

那么如何選擇合適的內參抗體呢?內參抗體雖然選擇較多,但是也需要遵循一定的原則,并契合實際的應用需要。推薦的內參要與檢測的目的蛋白的分子量相差5KD以上,因此需要根據目的檢測蛋白的分子量來選擇合適的內參,例如:GAPDH的檢測分子量大約在36kD,因此該內參抗體不是很適合用于檢測30kD-40kD大小目標蛋白的WB實驗中;β-Actin的檢測分子量大約在42kD,因此該內參抗體不是很適合用于檢測38kD-48kD大小目標蛋白的WB實驗中。另外,不同的組織來源的樣本在選擇內參時還有一定的區別。比如某些細胞中,由于組織缺氧、糖尿病等因素會導致GAPDH的表達增高,不適合做內參。另外,雖然β-Actin是zui合適的內參抗體之一,但是在某些條件下,一些因素也會導致樣品間β-Actin含量的變化,例如在脂肪組織里,β-Actin的表達量非常低,就不適合作為內參。

 

就一般的蛋白檢測來說,β-actin、β-Tubulin抗體等就可以了,而針對于核蛋白的定量,特別是樣本蛋白就是核蛋白時,選擇恰當的核蛋白內參則更能體現內部參照的價值。常用的核內參抗體有Lamin A、Lamin B、Histone H3,除此之外,其它常見的核蛋白內參還有PCNA、K70、K80等,在一些文獻報道中,Erk2、TATA binding protein(TBP)以及c-Jun、c-Fos等都有使用。而對于膜蛋白檢測,常用的內參抗體為Na,K ATPase。對于線粒體蛋白的檢測,常用VDAC1和COX IV作為內參抗體。

以上幾條原則只是針對通常情況,但是需要注意的問題是——內參的選擇需要考慮實際的試驗環境并查詢相應文獻,在實驗過程中也應該注意如果內參表達出現異常,應綜合考慮這方面因素。

 

愛必信部分內參抗體訂購信息如下,更多內參抗體信息詳情見。

貨號

產品名稱

反應種屬

應用

來源種屬

規格

abs830030

Anti-GAPDH Antibody

Human, mouse, African green monkey

WB,IP

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs118936        

GAPDH Polyclonal Antibody

Human Mouse Rat

WB, IHC, IF

Rabbit

50ul/100ul/500ul

abs130609

GAPDH Antibody

H, Mk

WB

Rabbit

50ul/100ul/500ul

abs132004

GAPDH antibody

Human, Mouse, Rat

WB,IHC, IF

Rabbit

50ul/100ul/500ul

abs137959

GAPDH Mouse Monoclonal Antibody

H, R, M, Mk, Dg, Ch, Hm, Rabbit,Pg

WB, IHC, IF

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs124037

Rabbit Anti-GAPDH Polyclonal Antibody

Human, Mouse, Rat, Rabbit,

WB,IHC-P,IHC-F,IF

Rabbit

50ul/100ul/500ul

abs139055

GAPDHS Antibody

Human

WB

Rabbit

50ul/100ul/500ul

abs100531

GAPDH Antibody, HRP Conjugate

Human

WB

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs830031

Anti-beta actin Antibody

human. mouse, African green monkey

WB、IP

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs132001

Beta actin antibody

Zebrafish,Dog,Monkey,Human,Mouse,Rat,Pig

WB,IHC,IF

Rabbit

50ul/100ul/500ul

abs119600

Rabbit Anti-beta Actin Polyclonal Antibody

Human, Mouse, Rat, Chicken, Dog, Pig, Cow, Rabbit, Sheep , Bee, Fish, Guinea Pig, Hamster, Goat, Cat, mt,op

WB,ELISA,IHC-P,IHC-F,Flow-Cyt,IF

Rabbit

50ul/100ul/500ul

abs137975

beta-Actin Mouse Monoclonal Antibody

Human; Monkey; Mouse; Rat; hamster; Dog; Spodoptera frugiperda; chicken,rabbit.Pg

WB, IHC, IF/ICC

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs112431

Beta-Actin Antibody

H, R

WB

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs830032

Anti-β-tubulin Antibody

human. mouse, African green monkey

WB,IP

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs119784

Rabbit Anti-Tubulin-beta Polyclonal Antibody

Human, Mouse, Rat, Pig, Cow

ELISA,IHC-P,IHC-F,Flow-Cyt,IF

Rabbit

50ul/100ul/500ul

abs131994

Tubulin beta Antibody

Human, Mouse, Rat

WB, IHC

Rabbit

50ul/100ul/500ul

abs137981

Tubulin beta Antibody

Zebrafish

WB

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs112431

Beta-Actin Antibody

H, R

WB

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs132184

beta-Actin antibody

Human,Mouse,Hamster,Rat,Monkey

ELISA, WB, ICC, FCM

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs137975

beta-Actin Mouse Monoclonal Antibody

Human; Monkey; Mouse; Rat; hamster; Dog; Spodoptera frugiperda; chicken,rabbit.Pg

WB, IHC, IF/ICC

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs100041

Beta-Actin Antibody

H, M, R

IHC-P, IF, WB

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs100006

Beta-actin Antibody

H, M, R

WB, IHC-P

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs100462

Histone H3 Antibody

H, R, M

WB

Mouse

50ul/100ul/500ul

abs112443

Histone H3 Antibody

H, R

WB

Mouse

50ul/100ul/500ul

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